Et af de centrale punkter i sundhedsloven er opgavefordelingen og samspillet mellem stat, regioner og kommuner. Staten fastlægger de overordnede rammer, kommunerne varetager direkte borgerrettede opgaver samt en række nye opgaver på sundhedsområdet, og de nye regioner får ansvaret for sygehus- og praksissektoren.
Det er fastlagt, at regionsrådet i samarbejde med kommunalbestyrelserne i regionen skal nedsætte et sundhedskoordinationsudvalg vedrørende den regionale og kommunale indsats på sundhedsområdet. Det er derudover fastlagt, at regionsrådet og kommunalbestyrelserne i regionen skal indgå en sundhedsaftale om varetagelsen af opgaver på sundhedsområdet, som godkendes af Sundhedsstyrelsen.
Alle regioner og kommuner skal udarbejde sundhedsaftaler minimum én gang i hver valgperiode.
Der skal indgås sundhedsaftaler på følgende seks obligatoriske indsatsområder:
- udskrivningsforløb for svage, ældre patienter
- indlæggelsesforløb
- træningsområdet
- hjælpemiddelområdet
- forebyggelse og sundhedsfremme, herunder patientrettet forebyggelse
- indsatsen for mennesker med sindslidelser
